Azure SQL Database v12用のWeb上のSQL管理ツールは、まだサポート外
フォーラムで次のような類似した質問があがっていました。
これに対して、中の人の回答は次の通り。
V11までのAzure SQL Database用には、Azure Management PortalからSQL Serverを管理するための機能が提供されています。
しかし、Azure SQL Databaseの新しいバージョン（v12）用にはまだ提供されていないのです。
なので、ポータル上からもリンクが無いのです。残念。
あとはSilverlightなので、今後を考えると何らかのツールに置き換わるのか、HTML5で実装しなおされていると想像しています。（注：別に非公開情報で知ったとかではなく、推測なので、このままDisconする可能性もあったり…）